在校园后山中，小学生大雄发现了一株被抛弃的树苗，随后被哆啦A梦的魔法唤醒，变成了活泼可爱的小家伙木木！木木明智敏捷，对学习充满热情，不仅让野比家所有人喜欢上了它，还成为胖虎、小夫、静香他们的最好朋友。
这天，他们四个在玩后山，没想到被吸入外星飞船之中！由于人类破坏地球生态环境日益严重，高智慧的植物宇宙人打算夺取地球上所有的植物来挽救自己濒临灭亡的命运。然而，失去植物，地球上的氧气就会减少，人类及其他动物都将逐渐灭亡！大雄和他们能否阻止宇宙人的行动？这部电影是根据日本漫画家藤子不二雄的原作改编而成。
