沿着历史线路奔跑的《仁医2》完结篇，带领我们回归江户时代，与许多已知名人物共舞。南方仁（大泽隆夫饰），身为医者，在这个时代生存下来，并将其开设的仁友堂走向正轨。当他了解到橘咲（绫濑遥饰）的母亲患上当年普遍的脚气病时，他立即决定制作并普及治愈这种病的点心。同时，出现在仁面前的坂本龙马（内野圣阳饰），带来一场新的大冒险。仁随之到京都，协助龙马救治苏醒的师父佐久间象山，而从后者口中获得了令人难以置信的往事….禁门之变造成了京都充满疮痍的景象，原本留下来为人救命的仁被强行带离城市，转移到萨摩藩当地医治西乡隆盛。随后，坂本龙马帮助了 west 乡隆盛与长州藩之间的结盟，成就了萨长同盟。在幕末日本局势骤然发生巨变时，仁对自己在这个时代的位置意义得到了新的认识。将来，他会再次邂逅寻找新生活的野风（中谷美纪饰），前篇中围绕在他们周身的谜团也将一个个被揭开....这部影片带给我们一场历史上的旅行，并为我们提供了更深入理解幕末日本的故事。
