一位醉心医学的少年华佗（林文龙），被引路经遇见名医张仲景。在救治一位孤疑的关云长（尹扬明）时，他发现了这个人所有者的病症非常特殊，并非普通的伤寒症状。因此，他结合《伤寒论》和《滋阴论》，成功研究出治疫瘟的方法。不幸的是，百姓多数仍然迷信鬼神之说，加上小人的祸心，对华佗来自各处的嫌和谤言，使他惹上杀身之祸。
张妙心（伍咏薇）是一位时景之长女，与华佗两情相悦，决定下嫁并随夫逃亡。华佗在许昌移居后变成了没有类的医生，无论病人多重的状况，他都为每一个人尽力拯救。由于失败的经常发生，他被评为“医死人大夫”，日子逐渐变得艰难。
好景不常，他替曹操（黄日华）的幼儿治病数年，被操赏识并封为太医院监，为创立医学大全而着手。不幸的是，操的奸雄本色逐渐显露出来，他命令华佗制毒药杀害关之士兵。华佗感到无法接受，投靠了关。Oper 病发，老羞成怒，以斩杀太医院内三百余人为胁力，迫使华佗回到许昌治病。华佗深知这个行为凶多吉少，难道这就是命运的安排？
