在无数草药之海中，我们的主角李时珍（林文龙饰）呈现出纯洁又迷人的科学精神。他曾与名字为吴慕榕（李诗韵饰）的美丽女子有过前世之交，但是却无法控制自己的心情，堕落在善良可爱的阿冬（叶璇饰）的目光之下。他决定将这份感情埋藏在内心深处，直到考完科举后向阿冬表白自己的情感。但是，在混沌中，他却没能够实现这一目标，反而结婚了吴慕榕。
李时珍发现当今世界上的医学书籍充满了错误和缺陷，于是冒着危险生命在心口中激起了《本草纲目》的念头。可是，他因为个性过于直接而惹恼了权贵，被迫暂时停止编写医学书籍，还不得不走上逃亡之旅途。幸运的是，太医院的庞宪（马国明饰）一路帮助和支持着他，最终，李时珍完成了旷世奇作《本草纲目》。这部伟大的作品将成为当今医学的基础，并且永远地塑造了他的名字。
