在SARS疫情幌茧中解散，人们终于看清了光明。神手的脑外科医生（吴启华饰）被女友离世消息震撼，心灵摔碎，感自自责与沉默。法医岑雅晴（黎姿饰）在他的左右，为他恢复信心。急性病科医生黎国柱（林保怡饰）终于结束了自己与前女友的恋情，却被骨科医生叶淘（吴美珩饰）及见习医生曾淑淇（廖碧儿饰）所围住。心脏科医生林敏智（陈豪饰）为了保护名望而隐瞒SARS感染，导致病情日益恶化。妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急性病科医生向众仁（曹永廉饰）计划共同生活，但由于护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入而面临一场情感考验。
《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列第三部作品，监制戚其义与编剧周旭明的合作精心打造“妙手系列”。这部电视剧继承了前两部经典的风格，借助医务人员的实景拍摄，再次为观众展示了医护人员在工作中的点滴故事。
