在清朝咸丰末期（1860年），大清国被长期封锁政策所造成的困难，导致国势骤然衰落。在这个动乱的背景下，一系列恩怨纠葛、合作以保家卫国的壮大故事发生。
台湾艋忠义堂是一所从世代传承下来的武馆，具有地方上相当的威望和影响力。其大弟子魏永来拥有超群武艺，但心灵狭隘、自私且追名利。老馆主年纪耄旧，因为见魏永来的内在问题，决定将管理权交由第二个弟子黄万里手中。
随着时间的流逝，魏永来不断勾引黄万里的女儿朱玉红，而其他弟子也开始出现。当年失散多年、生死未知的亲生子阿牛又出现在了这里。阿牛因为被口贩人奴隶卖去口谋，玉红见其惨状无法忍心，便将其收养回家。飞虎与朱玉红的三角恋爱也在此情景中发生。
阿牛向黄万里表达身世真相时，万里被惊喜之余发现，他正是他与朱惠娘所生的失散多年、生死未知的亲子！当初魏永来掌握重兵，朱惠娘也成了总兵夫人，这些恩怨在江湖中都有着相当复杂的背景。
黄万里与魏永来的恩怨该如何了结？法兰西人终于侵略台湾了，谁能够力挽狂澜，救百姓于水火之中呢？这些英雄好汉之间会有什么可歌可泣的故事呢？他们身上的香包又到底隐藏着什么秘密呢？
当年的永来重现江湖，而朱惠娘更竟然成了总兵夫人！这个故事中到底有着什么令人惊异且难以捉摸的恩怨呢？一波未平、一波又起，阿牛的身世真相会被揭开吗？他和飞虎两兄弟与朱玉红间的三角恋情，会有什么感人肺腑的发展呢？
