1999年，长峰博士在赤道附近发现了异常的加欧斯生物，同时在日本西南方海底发现了神秘的卡美拉墓场。
时光返回到1995年的东京，由于加欧斯侵袭，比良坂绫奈一家人准备逃离東京。 此时，卡美拉因受到加欧斯攻击而倒下，破坏了绫奈的家，使父母无法逃脱。 眼爲瞎见父母死亡的绫奈，从此就开始恨之入骨地憎恶卡美拉....
再次往回调整时机到1999年，居住在乡下亲戚家的绫奈遭受同学的折磨。 有一天，同学要求绫奈去供奉一个名为“柳星张”的神社，并要求她从里面拿出东西。 此时守卫神社多代传统的成员守部美雪察觉到异常，于是诣请自己的弟弟龍成来解决这个问题。 龍成驱除了同学，将东西给绫奈带回去，但在绫奈将东西拿走之前，两人发现了一个神秘物品......
此时，加欧斯出现在東京的涩谷空中，不久之后传来爆炸声，加欧斯被击中坠落在涩谷车站。 此时，卡美拉从天而降.....
