在新学年开始，震动了整个班级的是充满激情和独特气质的凉宫春日。她对世界上的普通人类并没有兴趣，但是希望找到来自外星、未来、异界或者拥有超能力的人们，为此创立了一支不可思议的学生会，名为SOS团。
尽管同班同学阿虚以及寡言女孩长门有希、萌萌教师朝比奈实玖瑠、神秘转学生古泉一树等人都被她招募，但是只有阿虚外的三人在与她相处时保持着大秘密。这些秘密将会对SOS团和整个世界造成深远而复杂的影响。
这部电影将带给你一份充满浪漫感动、幽默化和激情的旅程，从不同角度探索着一个不可思议的社团以及它的成员们所隐藏的真相。
